1.2.40.0.34.6.0.11.3.167/static-2021-02-02T111812

Id	1.2.40.0.34.6.0.11.3.167 ref at-cda-bbr-	Gültigkeit	2021‑02‑02 11:18:12
Status	Entwurf	Versions-Label	1.0.0
Name	atcdabbr_entry_LaboratoryIsolateOrganizer	Bezeichnung	Laboratory Isolate Organizer
Beschreibung Alle mikrobiologische Erregernachweise werden im zugehörigen section/text als Tabelle dargestellt. Jede Zeile dieser Tabelle enthält die Bezeichnung des Erregers, die Methodik der Untersuchungsdurchführung, die Keimzahl sowie gegebenenfalls einen Kommentar. Für jeden einzelnen Erregernachweises wird für die Codierung ein "Laboratory Isolate Organizer" verwendet. Für die Codierung des Erregers MUSS das Value Set "ELGA_Mikroorganismen_VS" verwendet werden; der Methodik enthält das Value Set "ELGA_Laborparameter" entsprechende Werte; der Keimzahl kann ein Wert aus dem Value Set "ELGA_NachweisErreger_VS" verwendet werden; quantitativ (z.B. Angabe der koloniebildenden Einheiten) erfolgen; der SNOMED-CT Code "255599008 Incomplete (qualifier value)" verwendet werden, um zu kennzeichnen, dass das Ergebnis noch folgt. der SNOMED-CT Code "281268007 Insufficient sample (finding)" verwendet werden, um zu kennzeichnen, dass zu wenig Material für die Untersuchung vorhanden war. Die Methodik sowie Keimzahl werden über einen "Laboratory Observation Entry" abgebildet. Über weitere "Laboratory Observation Entries" können z.B. die Time to Positivity codiert werden. Eventuell vorliegende Antibiogramme werden in einer separaten Tabelle im section/text dargestellt. Sollte die Matrix bei zu vielen Erregern zu unübersichtlich werden, wird empfohlen, die Erreger in der Tabelle des Erregernachweises zu nummerieren und in der Tabelle des Antibiogramms lediglich die Nummer des getesteten Keims als Spaltenüberschrift anzugeben. Innerhalb des "Laboratory Isolate Organizers" wird das Antibiogram eines Ergebnisses über einen "Laboratory Battery Organizer" und darin enthaltene "Laboratory Observation Entries" (für jedes Antibiotikum eine Observation) codiert. observation/code enthält den Code des getesteten Antibiotikums aus dem Value Set "ELGA_Antibiogramm_VS". Das Ergebnis kann sowohl quantitativ (MHK-Wert) über observation/value als auch qualitativ (RSI-Interpretation) über observation/interpretationCode codiert werden.
Klassifikation	CDA Entry Level Template
Offen/Geschlossen	Geschlossen (nur definierte Elemente sind erlaubt)
Benutzt	Benutzt 3 Templates Benutzt als Name Version 1.2.40.0.34.6.0.11.3.26 Containment Laboratory Battery Organizer (1.0.0) DYNAMIC 1.2.40.0.34.6.0.11.3.27 Containment Laboratory Observation Entry (1.0.0+20210311) DYNAMIC 1.2.40.0.34.6.0.11.3.11 Containment Comment Entry (1.0.0+20210219) DYNAMIC
Beziehung	Spezialisierung: Template 1.2.40.0.34.11.30025 Kultureller Keimnachweis (Laboratory Isolate Organzier) (2017‑02‑23) ref elgabbr- Version: Template 1.2.40.0.34.11.30025 Kultureller Keimnachweis (Laboratory Isolate Organzier) (2017‑02‑23) ref elgabbr-
Beispiel	Strukturbeispiel  : <!-- Level 2 - Narrativer Text -->  : <paragraph styleCode="xELGA_h3">Kulturergebnis</paragraph><table>   <thead>     <tr>       <th>Erreger</th>      <th>Methode</th>      <th>Keimzahl</th>      <th>Kommentar</th>    </tr>  </thead>  <tbody>     <tr ID="OBS-MIBI-1">       <td ID="OBS-MIBI-1-path">Staphylococcus epidermidis</td>      <td ID="OBS-MIBI-1-culture">Kultur</td>      <td ID="OBS-MIBI-1-count">positiv</td>      <td ID="OBS-MIBI-1-comment"/>    </tr>  </tbody></table><paragraph styleCode="xELGA_h3">Antibiogramm</paragraph><table>   <thead>     <tr>       <th>Wirkstoff</th>      <th>Staphylococcus epidermidis</th>    </tr>  </thead>  <tfoot>     <tr>       <td> S = sensibel bei Standarddosierung, I = sensibel bei erhöhter Exposition, R = resistent, [] minimale Hemmkonzentration in mg/L </td>    </tr>  </tfoot>  <tbody>     <tr ID="OBS-AB-1">       <td ID="OBS-AB-1-ab">Penicillin</td>      <td ID="OBS-AB-1-1-result">R</td>    </tr>    <tr ID="OBS-AB-2">       <td ID="OBS-AB-2-ab">Oxacillin</td>      <td ID="OBS-AB-2-1-result">S</td>    </tr>    <tr ID="OBS-AB-3">       <td ID="OBS-AB-3-ab">Erythromycin</td>      <td ID="OBS-AB-3-1-result">S</td>    </tr>    <tr ID="OBS-AB-4">       <td ID="OBS-AB-4-ab">Clindamycin</td>      <td ID="OBS-AB-4-1-result">S</td>    </tr>  </tbody></table><paragraph styleCode="xELGA_h3">Time to Positivity</paragraph><content ID="ttp">Time to positivity aerobe Blutkulturflasche: 18.9 Stunden</content>  : <!-- Level 3 - Codierung -->  : <organizer classCode="CLUSTER" moodCode="EVN">   <templateId root="1.2.40.0.34.6.0.11.3.167"/>  <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.5"/>  <statusCode code="completed"/>  <effectiveTime value="20210312142000+0100"/>  <!-- Nachgewiesener Erreger -->   <specimen typeCode="SPC">     <specimenRole classCode="SPEC">       <id extension="OBS-MIBI-1-path" root="1.2.40.0.34.99.4613.122082.1.3.5"/>      <specimenPlayingEntity classCode="MIC">         <code code="60875001" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96" codeSystemName="SNOMED-CT" displayName="Staphylococcus epidermidis">           <originalText>             <reference value="#OBS-MIBI-1-path"/>          </originalText>        </code>      </specimenPlayingEntity>    </specimenRole>  </specimen>  <!-- Methode und Keimzahl (in diesem Fall qualitativ) -->   <component typeCode="COMP">     <observation classCode="OBS" moodCode="EVN">       <templateId root="1.2.40.0.34.6.0.11.3.27"/>      <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.6"/>      <id extension="OBS-MIBI-1-culture" root="1.2.40.0.34.99.4613.122082.1.3.5"/>      <code code="11475-1" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.1" codeSystemName="LOINC" displayName="Microorganism identified in Specimen by Culture">         <originalText>           <reference value="#OBS-MIBI-1-culture"/>        </originalText>      </code>      <text>         <reference value="#OBS-MIBI-1-count"/>      </text>      <statusCode code="completed"/>      <effectiveTime nullFlavor="UNK"/>      <value xsi:type="CD" code="260373001" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96" codeSystemName="SNOMED CT" displayName="Detected (qualifier value)"/>    </observation>  </component>  <!-- Time to Positivity -->   <component typeCode="COMP">     <observation classCode="OBS" moodCode="EVN">       <templateId root="1.2.40.0.34.6.0.11.3.27"/>      <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.6"/>      <id extension="OBS-MIBI-1-culture" root="1.2.40.0.34.99.4613.122082.1.3.5"/>      <!-- TODO: muss noch in ELGA_Laborparameter übernommen werden -->       <code code="93789-6" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.1" codeSystemName="LOINC" displayName="Time to microorganism growth detection in Specimen"/>      <text>         <reference value="#ttp"/>      </text>      <statusCode code="completed"/>      <effectiveTime nullFlavor="UNK"/>      <value xsi:type="PQ" value="18.9" unit="[h]"/>    </observation>  </component>  <!-- Antibiogramm -->   <component typeCode="COMP">     <organizer classCode="BATTERY" moodCode="EVN">       <templateId root="1.2.40.0.34.6.0.11.3.26"/>      <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.4"/>      <code code="29576-6" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.1" codeSystemName="LOINC" displayName="Bacterial susceptibility panel"/>      <statusCode code="completed"/>      <component typeCode="COMP">         <observation classCode="OBS" moodCode="EVN">           <templateId root="1.2.40.0.34.6.0.11.3.27"/>          <templateId root="1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.6"/>          <!-- TODO: Laboratory Observation muss ELGA_Antibiogramm_VS noch erlauben -->           <code code="18964-7" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.1" codeSystemName="LOINC" displayName="Penicillin [Susceptibility]">             <originalText>               <reference value="#OBS-AB-1-ab"/>            </originalText>          </code>          <text>             <reference value="#OBS-AB-1-1-result"/>          </text>          <statusCode code="completed"/>          <effectiveTime nullFlavor="UNK"/>          <interpretationCode code="R" codeSystem="2.16.840.1.113883.5.83" codeSystemName="HL7:ObservationInterpretation" displayName="Resistant"/>        </observation>      </component>      <!-- : -->       <!-- : -->       <!-- Ergebnisse weiterer Antibiotika -->       <!-- : -->       <!-- : -->     </organizer>  </component></organizer>
Beispiel	Liste der noch einzufügenden Beispiele <!-- TODO Erreger nicht nachweisbar --> <!-- TODO Keime (oder Mikroorganismen) nicht nachweisbar --> <!-- TODO Wert folgt --> <!-- TODO ... -->
Item DT Kard Konf Beschreibung Label hl7:organizer (atc...zer) @classCode cs 1 … 1 F CLUSTER @moodCode cs 1 … 1 F EVN hl7:templateId II 1 … 1 M Laboratory Isolate Organizer (atc...zer) @root uid 1 … 1 F 1.2.40.0.34.6.0.11.3.167 hl7:templateId II 1 … 1 R IHE PalM TF3 Rev.10, 6.3.4.11 Laboratory Isolate Organizer (atc...zer) @root uid 1 … 1 F 1.3.6.1.4.1.19376.1.3.1.5 hl7:statusCode CS 1 … 1 M Der "statusCode" kann folgende Werte annehmen: completed: zu verwenden, wenn alle erwarteten Untersuchungsergebnisse für dieses Isolat abgeschlossen sind. aborted: zu verwenden, wenn zumindest ein Untersuchungsergebnis für dieses Isolat nicht abgeschlossen werden konnte (abgebrochen wurde). Der Wert "active" DARF NICHT verwendet werden. Befunde, die noch nicht abgeschlossen sind, sind mit ClinicalDocument/sdtc:statusCode[@code="active"] zu codieren. (atc...zer)   CONF @code muss "completed" sein oder @code muss "aborted" sein Auswahl 1 … 1 Medizinisch relevantes Datum und Zeit. In der Regel Abnahmedatum/-zeit des Spezimen. Elemente in der Auswahl: hl7:effectiveTime[not(@nullFlavor)] hl7:effectiveTime[@nullFlavor='UNK'] hl7:effectiveTime IVL_TS 0 … 1 (atc...zer) wo [not(@nullFlavor)] hl7:effectiveTime IVL_TS 0 … 1 (atc...zer) wo [@nullFlavor='UNK'] hl7:specimen 1 … 1 M (atc...zer) @typeCode cs 1 … 1 F SPC hl7:specimenRole 1 … 1 M (atc...zer) @classCode cs 1 … 1 F SPEC hl7:id II 0 … 1 Eindeutige ID des Labors für dieses Isolat. (atc...zer) hl7:specimenPlayingEntity 1 … 1 M (atc...zer) @classCode cs 1 … 1 F MIC hl7:code CE 1 … 1 M Codierung des ermittelten Keims mittels SNOMED-CT. Das Element code enthält ggf. ein Unterelement mit originalText/reference, das auf die Bezeichnung des Erregers referenziert, wie er dem Benutzer angezeigt werden soll (ggf. in Unterschied zu @displayName). (atc...zer)   CONF Der Wert von @code muss gewählt werden aus dem Value Set 1.2.40.0.34.10.188 ELGA_Mikroorganismen_VS (DYNAMIC) Auswahl 1 … * TODO: Laut IHE ist auch Multimedia auf dieser Ebene möglich - erwünscht? Elemente in der Auswahl: hl7:component welches enthält Template 1.2.40.0.34.6.0.11.3.26 Laboratory Battery Organizer (DYNAMIC) hl7:component welches enthält Template 1.2.40.0.34.6.0.11.3.27 Laboratory Observation Entry (DYNAMIC) hl7:component welches enthält Template 1.2.40.0.34.6.0.11.3.11 Comment Entry (DYNAMIC) hl7:component Der Laboratory Battery Organizer wird verwendet, um z.B. das Antibiogram des ermittelten Keims abzubilden. Beinhaltet 1.2.40.0.34.6.0.11.3.26 Laboratory Battery Organizer (DYNAMIC) (atc...zer) @typeCode cs 1 … 1 F COMP hl7:component Die Observation wird verwendet, um z.B. die Untersuchungsmethode sowie die ermittelte Keimzahl abzubilden. Beinhaltet 1.2.40.0.34.6.0.11.3.27 Laboratory Observation Entry (DYNAMIC) (atc...zer) @typeCode cs 1 … 1 F COMP hl7:component 0 … * Beinhaltet 1.2.40.0.34.6.0.11.3.11 Comment Entry (DYNAMIC) (atc...zer) @typeCode cs 1 … 1 F COMP